tre 

Opening TRE files

Onko .TRE-tiedoston avaamisessa ongelmia? Keräämme tietoa tiedostomuodoista ja voimme selittää, mitä TRE-tiedostot ovat. Lisäksi suosittelemme ohjelmistoja, jotka soveltuvat tällaisten tiedostojen avaamiseen tai muuntamiseen.

Mikä on .TRE tiedostotyyppi?

Tiedostonimipäätteellä .tre tarkoitetaan ensisijaisesti Maximum Clade Credibility (MCC) Tree (.tre) -tiedostotyyppiä, joka liittyy fylogenetiikan tietojen analysointiin. MCC-puut (.tre) edustavat todennäköisimpiä (uskottavia) tuloksia Bayesin päättelyanalyysistä, joka on suoritettu tietylle fylogeneettiselle aineistolle. .tre-tiedosto on yksittäinen MCC-puu. Se sisältää puumaisesti jäsennellyn joukon maantieteellisesti viitattuja tai indeksoituja fylogeneettisiä tietoja, joihin yleensä viitataan nimellä R-puu. .tre-tiedosto itsessään on suuri tekstidokumentti, joka voidaan avata suoraan tekstieditorilla, mutta sen mielekäs esittäminen on mahdollista vain asianmukaisen analyysi- tai visualisointityökalun avulla. MCC-puita, jotka on luotu esimerkiksi BEAST-ohjelmistolla (Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees), käytetään fylogeografisten tutkimusten tekemiseen, ja ne voidaan piirtää visuaalisesti FigTree-ohjelman kaltaisilla erityisillä työkaluilla. Google Earthissa visualisointia varten MCC-puut (.tre) voidaan muuntaa KML-muotoon.


Vaihtoehtoisesti .tre-pääte edustaa CCS C Compiler Call Tree (.tre) -tiedostotyyppiä, joka viittaa CCS, Inc:n kaupallisesti saatavilla olevaan PIC-mikrokontrollerien (Microchip Technology Inc.) ohjelmointiin tarkoitettuun koodinluontityökalusarjaan. Itsenäisen CCS C-kääntäjän lisäksi tällaisia työkaluja ovat PCW-kehitysympäristö ja sen muunnokset. Kutsupuu-tiedosto (.tre) sisältää täydellisen luettelon tietyn C-projektin funktiokutsuista sekä muistin käyttötiedot kullekin funktiolle. Kutsupuut (.tre) helpottavat virheenkorjausta ja koodin optimointia.


Edellä mainittujen lisäksi .tre-päätteellä voi esiintyä yhteydessä tiedostojärjestelmän hakemistopuita luoma eri tiedostojärjestelmän hallintatyökaluja ja tallennetaan .tre-tiedostoja. Tässä yhteydessä .tre-tiedosto on hierarkkisesti jäsennelty luettelo tiedostojen ja kansioiden nimistä, jotka edustavat tietyn hakemiston sisältöä. Vaikka hakemistopuissa (.tre) voidaan käyttää useita mielivaltaisia formaatteja, tällaiset tiedostot ovat yleensä tekstipohjaisia.



Ohjelmisto TRE-tiedostojen avaamiseen tai muuntamiseen

Voit avata TRE-tiedostoja seuraavilla ohjelmilla:
PCW
 
MEGA6
MEGA6 by Center for Evolutionary Medicine and Informatics
 
ImageMagick -7 Q16 (2012-03-01)
ImageMagick -7 Q16 (2012-03-01) by ImageMagick Studio LLC
 
MEGA7
MEGA7 by iGEM
 
TreeView X
TreeView X by Roderic D. M. Page
 


Suosittuja tiedostomuotoja

Video-oppaat