Wat is het .TRE bestandstype?
De bestandsnaamextensie .tre duidt in de eerste plaats op het bestandstype Maximum Clade Credibility (MCC) Tree (.tre) dat wordt geassocieerd met gegevensanalyse in de fylogenetica. MCC bomen (.tre) vertegenwoordigen de meest waarschijnlijke (geloofwaardige) resultaten van een Bayesiaanse inferentie analyse uitgevoerd tegen een gegeven set van fylogenetische gegevens. Een .tre bestand is een enkele MCC boom. Het bevat een boomachtige gestructureerde set van geografisch gerefereerde of geïndexeerde fylogenetische gegevens, meestal aangeduid als de R-tree. Het .tre-bestand zelf is een groot tekstdocument dat rechtstreeks kan worden geopend in een teksteditor, maar de zinvolle weergave ervan is alleen mogelijk met een goed analyse- of visualisatie-instrument. MCC bomen, gegenereerd door software zoals BEAST (Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees), worden gebruikt om fylogeografische studies uit te voeren en kunnen visueel worden geplot met behulp van specifieke instrumenten zoals FigTree. Voor visualisatie in Google Earth kunnen MCC-bomen (.tre) worden geconverteerd naar KML.
Als alternatief staat de .tre-extensie voor het bestandstype CCS C Compiler Call Tree (.tre), dat verwijst naar een reeks hulpmiddelen voor het genereren van code voor het programmeren van PIC-microcontrollers (Microchip Technology Inc.), die commercieel verkrijgbaar zijn bij CCS, Inc. Naast de standalone CCS C Compiler omvatten dergelijke gereedschappen de PCW geïntegreerde ontwikkelingsomgeving en de subversies daarvan. Een call tree (.tre) bestand bevat een complete lijst van functie-aanroepen in een gegeven C-project, samen met geheugengebruiksgegevens voor elke functie. Aanroepbomen (.tre) dienen om debugging en code-optimalisatie te vergemakkelijken.
Afgezien van het bovenstaande kan de .tre-extensie voorkomen in verband met mapstructuren van het bestandssysteem die door diverse beheersprogramma's voor het bestandssysteem worden gegenereerd en als .tre-bestanden worden opgeslagen. In deze context is een .tre-bestand een hiërarchisch gestructureerde lijst van bestands- en mapnamen, die de inhoud van een bepaalde map vertegenwoordigt. Hoewel voor directorybomen (.tre) een aantal willekeurige formaten kunnen worden gebruikt, zijn dergelijke bestanden normaal gesproken tekstgebaseerd.
Software om TRE bestanden te openen of omzetten
U kunt TRE bestanden met de volgende programma's openen:
MEGA6 by Center for Evolutionary Medicine and Informatics